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Ingénierie des génomes et ARN interférence

Ingénierie des génomes et ARN interférence

UE commune Université Paris-Saclay et Université Paris Cité

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Responsable

Christine LELANDAIS-BRIERE (Université Paris Cité).

Prérequis

Bon niveau en biologie moléculaire et biologie cellulaire d’une Licence générale en Sciences du vivant.

Contenu

Cet enseignement a pour objectifs:
1) de former les étudiants aux méthodologies d’ingénierie et édition des génomes, de biologie de synthèse et aux technologies médiées par les ARNs, en particulier l’extinction génique par ARN interférence
2) de décrire les bases moléculaires des mécanismes de régulation génique médiés par des ARN non codants et de réparation/recombinaison de l’ADN sous-jacents à ces technologies
3) de présenter des développements envisagés et des applications dans les domaines des productions végétales et de la santé
4) de réfléchir aux défis sociétaux, environnementaux et éthiques associés au développement de ces biotechnologies.

Format

  • Cours: Les technologies d’ingénierie des génomes, biologie de synthèse et ARN interférence: principes, mécanismes moléculaires sous-jacents et applications.
  • TD: exemples d’applications
  • TP: le silencing chez les plantes
    Au cours du TP, les étudiants réalisent l’analyse de lignées d’Arabidopsis thaliana soumises à différents types de silencing et mettent en évidence la systémie en réponse à une attaque virale. Ils réalisent les clonages destinés à une stratégie RNAi. Ce TP leur permet non seulement de s’initier aux techniques de biologie moléculaire dédiées à l’analyse des petits ARNs interférents et de la méthylation de l’ADN mais aussi de s’exercer à des techniques classiques de transgenèse, biologie moléculaire et cellulaire végétales (RT-PCR quantitative, clonage, détection de protéines rapporteurs…).
  • Séminaires (4h)
  • Travail personnel : compte-rendu de TP, préparation des séminaires, des TD et de l’examen.

Bibliographie

  • Biotechnologies. Les promesses du vivant, 2015, Vanessa Proux, Collectif, Fyp
  • Stable RNA interference rules for silencing, Fellmann and Lowe, 2014, Nature Cell Biology, vol 16
  • https://www.cell.com/nucleus-CRISPR
  • Synthetic biology: Recent progress, biosafety and biosecurity concerns, and possible solutions, Wang and Zhang, 2019, Journal of Biosafety and Biosecurity
  • The next generation of CRISPR–Cas technologies and applications, Pickar-Oliver & Gersbach, 2019, Nature Reviews Molecular Cell Biology volume 20, pages 490–507.

Français
UE au choix (Choix entre cette UE "Ingénierie des génomes et ARN interférence" et l'UE "Physiologie de la nutrition et agronomie").
CM: 14h, TD: 6h, TP: 24h
ECTS: 4
Lieu(x): Paris